欢迎来加快集KevinMD的播客。特雷弗贝德福德是计算生物学家和传染病学家弗雷德哈钦森癌症研究中心。他被选为接受者的2021麦克阿瑟奖学金,可以达到在Twitter上@trvrb。
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MD:嗨,凯文•越南河粉,欢迎给我们分享的故事很多人与我们的卫生保健系统相交,但很少听到。我的名字是凯文越南河粉,KevinMD的创始人和编辑。今天在节目中我们有特雷弗贝德福德,他是一个计算生物学家和传染病学家弗雷德哈钦森癌症研究中心在西雅图,华盛顿。他获得了2021年的麦克阿瑟奖学金,否则称为麦克阿瑟“天才格兰特。“他的Twitter是一个在大流行期间。。我每天都跟随它,你可以在Twitter上找到他@trvrb。特雷福,欢迎来到。
特雷弗•贝德福德博士:谢谢你邀请我,凯文。很高兴来到这里。
MD:凯文•越南河粉让我问你什么是计算生物学家?你能举个例子COVID大流行期间专业知识在行动?
特雷弗•贝德福德博士:所以我的主要重点是病毒序列数据。所以流感大流行之前,埃博拉病毒和Zika病毒,和所有这些事情,当有人被感染,你可以拭子和序列的病毒,你得到这个基因组的10000或30000个字母,你能了解事情的演变和传播病毒的基因组序列。所以很多纯科学产出真的是关注学习从这个序列进化和流行病学数据。我们在实验室里做一些测序弗雷德厨,但主要是我们依靠的是公开可用的序列数据或序列数据的合作者。
凯文越南河粉,医学博士:我们是在周五下午,12月17日,当这出来ο抓住在美国。如何ο变异不同于之前的变种COVID吗?
特雷弗•贝德福德博士:所以ο带我,我认为基本上每个人都感到十分惊讶。所以我们有这个超级方差在2021年的春天,α,β,γ、δ,等等。δ最终被比其他人更强的传染性,它胜过了,三个星期前,99%的感染,这样,整个地球三角洲。现在在短短几周后,我们将达到50%ο非常迅速。
这是一个非常不同的病毒基因组所以最好的假设我仍然疲弱,但假设,这样的进化,在一个孵化慢性感染在非洲南部也许一年,超过一年,然后积累大量的这些突变,试图逃避免疫,这并不是一种完全能够清除感染但足以推动该病毒的进化。然后当它溢出的慢性感染,你最终得到的东西是相当传播在很大程度上是因为逃避现有的免疫力,因为足够突起蛋白发生了变化,现有的抗体从自然感染和疫苗接种也不要不工作。
凯文越南河粉,MD:你提到ο惊讶你和其他科学家。这是为什么呢?
特雷弗•贝德福德博士:我希望现在有这么多的免疫力在全球人口,一种切换到进化的主要抗原漂移,更类似流感,在那里你可以有新的变种,新品种出现,取代现有的菌株,可以更新疫苗,这一切完全是预期。但我期待更类似流感,我们有一个新菌株出现,然后在几个突变,突变,而买卖的出现完全与这些30突变在左外野突起蛋白看起来像从2031年的流感方面的进化的发生。这是突然的东西非常不同。
凯文越南河粉,医学博士:嗯,这是非常不同的,影响大流行的轨迹如何?
特雷弗•贝德福德博士:我们知道这是传播非常迅速,基本上,我关注的是这个数字Rt,继发感染,感染原因或情况下这一情况的原因。早在2020年2月,与原Wuhan-like病毒约三个半在西雅图和西欧一样蔓延在缓解措施真正巨大的带下来。4月/ 5月最初的δ波是一个Rt约一个半,和现在ο在西雅图和伦敦,甚至可能是三个或四个,如果不是甚至略高。
所以更多的比我们基本上见过以往任何时候都更快的传播。我们可以期待受案量高于我们看到整个大流行,所以现在基本上就是一个问题之前我们至少知道由于免疫力,很可能是因为实际内在严重性的每箱水平结果将比以前更温和ο波。它有多大的病例数和大小是一小部分严重的结果,,两个在一起将决定这实际上有多坏。
凯文越南河粉,MD:所以看看ο海外传播在南非和欧洲,当你期望οδ在美国取代?
特雷弗•贝德福德博士:在西雅图,我们买卖为今天的50%左右。纽约,看起来也许有点过去。其他地方需要一段时间才能赶上,但倍增时间是每隔两到三天所以它不会花很长时间。是的,给它一个星期。取代现在这个词,我看仔细,如果我们看看南非,很难说因为三角洲从如此低的分数。你仍然可以发现在南非三角洲循环提供最新的基因组序列,所以完全不清楚是否ο刚刚或实际上已经取代δ。
它一定会是,绝大多数的情况下被发现在美国和欧洲将买卖,但这将是…我不知道多少的削弱会投入三角洲,也许我可以想象在伦敦和欧洲等地,他们可能会做更多的缓解,更多的药物干预,δ可能会死。在美国,我们可能会更少,我们可能会看到更少的影响比三角洲,但这是我将仔细看。
凯文越南河粉,MD:让我们来谈谈ο造成感染的严重程度。所以我一直到处看到文章。所以我想最初在南非,有些人说让更轻微的疾病,但现在我看到其他科学家称,在问题。那么你的想法是什么疾病严重程度的买卖给吗?
特雷弗•贝德福德博士:是的,这是令人沮丧的悬而未决。我的意思是,只有…这是几个星期和传播如此之快,即使这是正常的临床病程,我们预计的时间积累的严重结果。这是一个非常,非常困难的问题。我认为我们可以确定,很大一部分ο感染是发生在一些患者免疫力,要么从自然感染或接种疫苗。我们知道从以前的我们看着减弱免疫和加强注射等等,通常你会有这个东西,如果免疫力并不完美,下降了一点,通过减弱或病毒进化,你可能会失去保护感染但你通常会保留保护严重的结果。
所以我认为很大一部分,也许并不是所有的,但很大一部分减少的严重程度是由于观察到这些感染大部分在南非和现在在人之前,有免疫力。这本身会减少,会减少程度。所以我们可以有很高的案件数量在美国和欧洲,也许没有那么多严重…作为一个比率,我们不会有尽可能多的严重的结果说,δ波。我还没能确定,我还没有看到任何真正好的证据是否也有一些从ο内在更温和的疾病。我可以想象,既然如此,但是,好像是的,试图拨打确切数量严重程度,仍然是困难的。
凯文越南河粉,MD:这是关于买卖当然可能将很快的主要菌株。是它可能完全vax被定义为三个疫苗?
特雷弗•贝德福德博士:我们讨论当我们谈论保护吗?看起来两剂和减弱,因为如果人们得到了他们的第二个剂量的辉瑞/现代化,说4月回来,会不会有很多从ο抵御感染。我们说的可能20%、30%的疫苗有效性对有症状的疾病,而第三个剂量从英国公共卫生工作将在大约70%有症状的疾病,这是很好。所以一种相当大的差异。但我们应该期望两剂仍将提供一些体面的防范住院和死亡。所以也许看到更多的人让他们的第三个剂量之间的二分法,不成为感染症状,人有两个剂量往往成为感染的症状。
凯文越南河粉,MD:把COVID流行历史背景。有过去的大流行,可以与我们目前和COVID经历吗?
特雷弗•贝德福德博士:我一直在思考这个问题很多这进化前,因为它绝对是我要的重点,如果你看看说2009年猪流感,感染30%的世界和在它的第一年出现在2009年,但是我们几乎没有看到尽可能多的进化。没有像猪流感的变异有变异SARS-CoV-2一样,如果我们看看埃博拉和Zika病毒,是的,的数量的进化或有效的进化,这种病毒的进化,重复序列改变,但实际上的新小说变异产生影响,我真的想不出一个类比。我们可能有这1918年,我们没有好的排序,但是最近的事情很非凡看到这种级别的进化。
凯文越南河粉,MD:现在的轨迹COVID希望成为流行,当你认为时间会来吗?
特雷弗•贝德福德博士:我们迅速接近它,我不会得到这些数字完美与类似美国总人口的60%已经接种疫苗。与类似美国总人口的35%被感染,我们可以预计…这是什么?如果我们用这个,就像80%的人口有免疫力,在流行状态,我希望基本上100%的人口有免疫力。所以我们接近那里。ο让我更担心特有的状态是什么样子如果病毒可以…如果每年或这样的出现,我们会得到很多…同样,即使我们没有很多严重的结果,你会得到大的攻击速度,巨浪,由于病毒的进化的时尚,这将是破坏性的。
凯文越南河粉,MD:然后它可能我们可能需要新的买卖特定或任何特定变体COVID投篮每6或12个月?
特雷弗•贝德福德博士:在买卖之前,我的期望是,每年九月会有COVID疫苗,人们感兴趣的需要就像流感疫苗,因为信使rna是一种更快的平台比流感种植的鸡蛋,你也许可以应变选择决定在6月,而不是流感,它是由2月。所以由于季节性和地方的特性和免疫力,一旦进入常规的周期,我希望像流感一样,像其他呼吸道病毒,一个冬天COVID季节之后,在夏天不流通,所以你每年接种疫苗的时间一致。
我一直期待,只是一个我们与流感毒株交换方式,但我认为,是的,只是讨论,我无法想象,我们都οδ9月的后裔οδco-circulating的后裔,我们可能希望疫苗有两种微妙,应该容易可行的信使核糖核酸疫苗,但是这是我们必须做准备,现在监管框架,让…让工作真正准备9月。
凯文越南河粉,医学博士:我是一个初级护理内科医生,在我考试的房间里,我得到了很多关于自然免疫力的问题。什么是天然免疫的作用在即将到来的ο波?
特雷弗•贝德福德博士:基于大多数疫苗有效性的研究与病毒中和试验工作,你通常看到自然感染比疫苗接种有更多的变化。和一些人感染滴度高于两剂,很多次低。平均而言,略低。但主要不是超级不同。现在真正的比较基本上是两剂和一些COVID和自然感染几乎相当于三个剂量的可能真的想要在这个领域与预防疾病症状的不是很多人只是自然感染或只有两剂。
MD:凯文•越南河粉有什么东西让你夜不能寐COVID流行吗?
特雷弗•贝德福德博士:所以我认为买卖,这个独具一格的进化的东西完全不同,如果在不断发生,如果是不同的所以它不会取代三角洲。所以,2022年9月,我们都有买卖的后代和δ后代流传,每年发生的,你可以保持叠加co-circulating SARS病毒。他们会提供一些免疫互相严重疾病,但仍将是你所期待的地方更高的疾病负担和循环水平远高于场景只是一个应变的演变和替换另一个我们与流感。这将是一个挑战跟上疫苗接种战略。
MD:凯文•越南河粉,我的最后一个问题。什么你回家的消息,你想离开凯文MD观众?
特雷弗•贝德福德博士:现在,买卖,你可以做的最好的事情是得到第三个剂量的疫苗。我非常推荐这样做,将…保护从有症状的疾病,但也保护你的邻居,你的社区从开始蔓延。它不会是完美的,但这将是最简单的,最好的办法。我回到有点像行为在一年前我被接种疫苗之前认为我不…我去超市购物时,我得到了外卖,我在咖啡店喝咖啡,但是我不坐在在餐馆。可能与小聚会,立即快速测试,但是绝对调节我的行为有点让这波1月不是那么糟糕的卫生保健系统,即使我自己的个人风险有三个剂量很低。
凯文越南河粉,MD:特,感谢你加入我,分享你的时间和洞察力。
特雷弗•贝德福德博士:非常感谢你,凯文。谢谢你邀请我。
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